بررسی نشانگر کلروپلاستی trnL-F در تعیین تمایز دو گونه صنوبر: سفیدپلت و سپیدار

Authors

Abstract:

هدف این تحقیق بررسی قدرت نشانگر کلروپلاستی trnL-F در تمایز ژنتیکی و ارتباط فیلوژنتیکی سپیدار (Populus alba) و سفیدپلت (Populus caspica) است. تعداد 15 نمونه برگی از هفت رویشگاه مختلف جنگل های هیرکانی ایران؛ استان های گیلان و مازندران، جمع آوری شدند. DNAی ژنومی از برگ ها با استفاده از روش ترکیبی CTAB و SDS- پتاسیم استات استخراج گردید. واکنش PCRی با استفاده از پرایمرهای جهانی انجام شد و قطعات trnL-F تکثیر شده توالی یابی گردید. نتایج نشان دادند که طول منطقه trnL-F تقریبا برای جمعیت های هر دو گونه در حدود 392-394 نوکلئوتید است. در مقایسه با توالی های موجود در بانک ژنی، تعداد نوکلئوتیدهای آدنین و تیمین در سفیدپلت و سپیدار بیش تر از دیگر نوکلئوتیدها است. ترکیب نوکلئوتیدی این دو گونه بسیار مشابه با حداقل فاصله ژنتیکی از یکدیگر (= 005/0) می باشد. آنالیز پارسیمونی از 582 جایگاه نوکلئوتیدی؛ 178 جایگاه محافظت شده، 197 جایگاه متغیر، 151 جایگاه پارسیمون و 46 جایگاه انحصاری را نشان داد. رسم درخت فیلوژنی براساس نشانگرtrnL-F نیز نشان داد که توالی این نشانگر نمی تواند تمایز بین پایه های دو گونه سپیدار و سفیدپلت ایجاد کند چراکه نمونه های بررسی شده در یک گروه مشترک قرار گرفتند. از نتایج این تحقیق می توان استنتاج نمود که نشانگر کلروپلاستی trnL-F نتوانست دو گونه سپیدار و سفیدپلت را از یکدیگر متمایز نماید. بنابراین برای شناخت دقیق این گونه ها، بازسازی فیلوژنی با استفاده از سایر نشانگرهای کلروپلاستی و یا هسته ای پیشنهاد می گردد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی نشانگر کلروپلاستی trnl-f در تعیین تمایز دو گونه صنوبر: سفیدپلت و سپیدار

هدف این تحقیق بررسی قدرت نشانگر کلروپلاستی trnl-f در تمایز ژنتیکی و ارتباط فیلوژنتیکی سپیدار (populus alba) و سفیدپلت (populus caspica) است. تعداد 15 نمونه برگی از هفت رویشگاه مختلف جنگل های هیرکانی ایران؛ استان های گیلان و مازندران، جمع آوری شدند. dnaی ژنومی از برگ ها با استفاده از روش ترکیبی ctab و sds- پتاسیم استات استخراج گردید. واکنش pcrی با استفاده از پرایمرهای جهانی انجام شد و قطعات trnl...

full text

بررسی بیوسیستماتیکی تیره های ی eaه Lorant hac و Viscaceae بر اساس ترادف ITS هسته ای و trnL-F کلروپلاستی

تیره اسرتس سررده ارای ایرا تیررهر اساسرار در نروایم گر ریری نیمرهگر یری جهرا گ رشرد دارنر س اعضرای ایرا تیررهر در د نه ره یجغرافیایم از جمله نوایم البرز ق مت ارای رزر ی ایررا پررازندارن س تاز و اایم زه در ایا آنالی ورد بررسم قرار گرفشن شرا لسرده انگل دروشا بلوط است Loranthaceae دارای سه سرده با پنج گونه نیمه انگل در ایرراLoranthus است زره ورود د گونره دارد: L. europaeus زرهL. grewinkii زه ی با ...

full text

بررسی بیوسیستماتیکی تیره های ی eaه lorant hac و viscaceae بر اساس ترادف its هسته ای و trnl-f کلروپلاستی

تیره اسرتس سررده ارای ایرا تیررهر اساسرار در نروایم گر ریری نیمرهگر یری جهرا گ رشرد دارنر س اعضرای ایرا تیررهر در د نه ره یجغرافیایم از جمله نوایم البرز ق مت ارای رزر ی ایررا پررازندارن س تاز و اایم زه در ایا آنالی ورد بررسم قرار گرفشن شرا لسرده انگل دروشا بلوط است loranthaceae دارای سه سرده با پنج گونه نیمه انگل در ایرراloranthus است زره ورود د گونره دارد: l. europaeus زرهl. grewinkii زه ی با ...

full text

پارامترهای رشد جمعیت دو گونه از شته های جنس chaitophorus روی سفیدپلت populus caspica bornm و سپیدار populus alba l.

پارامترهای رشد جمعیت شته chaitophorus populeti panzer روی سفید پلت و شتهchaitophurus leucomelas (koch) روی سپیدار با شرایط دمایی 1 ± 25 درجه سانتی گراد، رطوبت نسبی 5± 65 درصد و دوره نوری 16 ساعت روشنایی و 8 ساعت تاریکی مطالعه شد. مدت زمان لازم برای کامل شدن مراحل نابالغ و بالغ شته c. populetiروی سفیدپلت به ترتیب 0833/0 ± 92/6 و 621/0 ±48 /9 روز به دست آمد. این مقادیر برای شته c. leucomelas روی ...

15 صفحه اول

کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تمایز دو گونه‌ Lolium perenne و Lolium multiflorum

چچم یکی از گیاهان مهم علوفه­ای در مناطق سردسیری جهان می­باشد و در شرایط مختلف آب و هوایی رشد می­کند. تنوع ژنتیکی دو گونه  بین نه ژنوتیپ از Lolium perenne و نه ژنوتیپ از Lolium multiflorum با استفاده از 15 نشانگر مولکولی SCoT بررسی شد. آغازگر­های ScoT در مجموع 86 باند تولید کردند که از این تعداد 12 باند یک‎شکل مشاهده شد و سایر باندها چند‎شکل بودند. آغازگرهای SC35، SC36 و SC26 به‎ترتیب با 9 و 8 ب...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی populus alba و populus caspicaدر مناطق غرب جنگل های هیرکانی ایران با استفاده از مارکر مولکولی trnl-f

سفیدپلت، بومی جنگل های هیرکانی شمال ایران است، که شباهت ریختی بسیاری با سپیدار دارد. هدف این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی populus alba و populus caspicaدر مناطق غرب جنگل های هیرکانی با استفاده از نشانگر مولکولیtrnl-f است. برای این منظور 12 نمونه برگی شامل 10 نمونه سفیدپلت و 2 نمونه سپیدار از 5 رویشگاه مختلف جمع آوری شدند. dnaی ژنومی از برگ نمونه ها با استفاده از ctab و sds- پتاسیم استات استخراج گردی...

15 صفحه اول

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 27  issue 4

pages  506- 519

publication date 2015-02-20

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023